Mùa này Baena đã ra sân 8 lần cho Atletico tại La Liga, đóng góp 4 bàn thắng và 2 kiến tạo, trực tiếp tham gia vào 6 bàn thắng, vượt qua tổng số của anh ở giải vô địch quốc gia mùa trước.
Ở vòng đấu này của La Liga, Atletico thắng Alaves 2-1 trên sân khách. Baena vào sân thay người ở phút 46 và kiến tạo để Cristian Romero ghi bàn ở phút 87, giúp đội bóng một lần nữa vươn lên dẫn trước. Trong trận này, anh đóng góp 1 kiến tạo và còn thực hiện 3 đường chuyền quyết định.
Ở mùa giải 2025/26, Baena ra sân 27 lần cho Atletico tại La Liga, đóng góp 2 bàn thắng và 3 kiến tạo, tổng cộng trực tiếp tham gia vào 5 bàn thắng. Mùa này chỉ sau 8 lần ra sân, số bàn thắng anh trực tiếp tham gia đã nhiều hơn mùa trước 1 bàn.